Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spire1Q52KF3 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms