Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm9125-202ENSMUST00000180746 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm9117-202ENSMUST00000193529 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Pogk-203ENSMUST00000131487 8692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm20518-201ENSMUST00000150068 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Fam168a-202ENSMUST00000107042 6388 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Cpeb1os1-201ENSMUST00000207156 2112 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Elovl4-201ENSMUST00000034796 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Ap5m1-201ENSMUST00000037473 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Fam168a-201ENSMUST00000049053 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Itsn1-208ENSMUST00000114002 14012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Ddx5-201ENSMUST00000021062 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gtpbp8-204ENSMUST00000162512 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Ldb2-201ENSMUST00000070748 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Unc13d-203ENSMUST00000106451 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Lrrc43Q3V0L5 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Lrrc43Q3V0L5 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Lrrc43Q3V0L5 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Lrrc43Q3V0L5 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Lrrc43Q3V0L5 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Lrrc43Q3V0L5 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Lrrc43Q3V0L5 Ndst2-201ENSMUST00000047490 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Lrrc43Q3V0L5 Bves-201ENSMUST00000095715 4368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Lrrc43Q3V0L5 Egf-209ENSMUST00000199615 3211 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Nup107-202ENSMUST00000167943 3098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Olfr429-202ENSMUST00000216346 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm20045-201ENSMUST00000192658 5577 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Lrrc43Q3V0L5 Cwc22-205ENSMUST00000111824 2603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 4931406P16Rik-201ENSMUST00000085592 5798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Dhrs7b-202ENSMUST00000108718 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Sp1-202ENSMUST00000163709 3134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Cpa5-203ENSMUST00000115139 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm11548-201ENSMUST00000140203 2199 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm26184-201ENSMUST00000157686 131 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms