Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm12378-201ENSMUST00000116171 1461 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Dusp27-202ENSMUST00000192369 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm14131-201ENSMUST00000119636 719 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Olfr1357-203ENSMUST00000205085 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm44639-201ENSMUST00000205859 3009 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Greb1-203ENSMUST00000159120 6346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 AC154300.1-201ENSMUST00000219735 2627 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm33994-201ENSMUST00000193724 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Phldb2-202ENSMUST00000076333 5347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 AC154314.1-201ENSMUST00000223995 2996 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Dclre1c-202ENSMUST00000100463 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Afap1l2-202ENSMUST00000118800 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Olfr152-203ENSMUST00000215394 2172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm32335-201ENSMUST00000216896 2948 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Csnk1g1-209ENSMUST00000205379 4001 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 D630045J12Rik-206ENSMUST00000169256 10968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 A530064D06Rik-202ENSMUST00000053612 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Nek11-201ENSMUST00000038648 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Zic3-203ENSMUST00000088631 2980 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Tgm4-201ENSMUST00000026893 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Lrrc18-201ENSMUST00000038956 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Fam198a-201ENSMUST00000043011 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Dbndd2-203ENSMUST00000109349 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Zc3h3-201ENSMUST00000100538 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Col28a1-201ENSMUST00000115537 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Ttc21a-201ENSMUST00000035100 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Mitf-203ENSMUST00000101123 2144 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Mitf-204ENSMUST00000113339 2144 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Rpl21-ps8-201ENSMUST00000130005 478 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm16031-201ENSMUST00000153253 448 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm17572-201ENSMUST00000171455 420 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm29517-201ENSMUST00000190744 351 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Mllt11-202ENSMUST00000196025 624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm44233-201ENSMUST00000203616 226 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Chmp2a-204ENSMUST00000211344 606 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Chmp2a-206ENSMUST00000211626 726 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 1700001C02Rik-201ENSMUST00000031078 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Mgat4a-201ENSMUST00000042161 7030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Arpp19-209ENSMUST00000169492 3963 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Atp2c1-212ENSMUST00000176770 2781 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Mapk6-202ENSMUST00000168937 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gsap-201ENSMUST00000036031 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Ebf2-201ENSMUST00000022637 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Dnaic1-201ENSMUST00000102963 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Col19a1-201ENSMUST00000051344 3336 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Btbd11-202ENSMUST00000105306 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Wdr37-201ENSMUST00000021572 4526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Zfp93-202ENSMUST00000108438 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Prnd-204ENSMUST00000110172 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Fshb-201ENSMUST00000028533 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Art4-201ENSMUST00000032341 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms