Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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