Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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