Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm13915-201ENSMUST00000119314 931 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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