Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Slc38a2-201ENSMUST00000023099 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Eya3-203ENSMUST00000081726 5160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Zkscan8-201ENSMUST00000045228 8805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Cdc42bpa-218ENSMUST00000212756 5247 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Sptan1-201ENSMUST00000046257 7820 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Med1-201ENSMUST00000018304 5845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Map3k13-201ENSMUST00000042065 6709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.8 ms