Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms