Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm46123-201ENSMUST00000217447 6424 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Mast4-212ENSMUST00000171791 7647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Map3k7-203ENSMUST00000108183 5416 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Sptan1-202ENSMUST00000095083 7883 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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