Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm43618-201ENSMUST00000197392 3451 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Ctnnd1-216ENSMUST00000111690 5945 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Srgap2-201ENSMUST00000097588 8026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gli3-201ENSMUST00000110510 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Ltn1-201ENSMUST00000039449 7737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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