Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 AY702103-202ENSMUST00000180996 5876 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Stag3-201ENSMUST00000048028 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Ttc28-201ENSMUST00000040111 10780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Add2-209ENSMUST00000204059 8182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Mcm10-202ENSMUST00000102985 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Ppp4r1l-ps-205ENSMUST00000141051 4466 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Sbno1-216ENSMUST00000199808 10161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms