Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ercc8Q8CFD5 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms