Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Atg4aQ8C9S8 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Atg4aQ8C9S8 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Atg4aQ8C9S8 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Atg4aQ8C9S8 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Atg4aQ8C9S8 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Atg4aQ8C9S8 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Atg4aQ8C9S8 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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