Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Frrs1-202ENSMUST00000195905 6823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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