Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Snx27Q3UHD6 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Snx27Q3UHD6 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Snx27Q3UHD6 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Snx27Q3UHD6 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Snx27Q3UHD6 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Snx27Q3UHD6 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx27Q3UHD6 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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