Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Irx1P81068 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms