Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VdrP48281 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VdrP48281 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VdrP48281 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
VdrP48281 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VdrP48281 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VdrP48281 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VdrP48281 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VdrP48281 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm16409-201ENSMUST00000100510 747 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Rps6-ps4-201ENSMUST00000118499 750 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm9143-201ENSMUST00000120745 745 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm8172-201ENSMUST00000120762 750 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm14749-201ENSMUST00000121269 333 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Mir3072-201ENSMUST00000175610 83 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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VdrP48281 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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VdrP48281 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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VdrP48281 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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VdrP48281 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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VdrP48281 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
VdrP48281 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
VdrP48281 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
VdrP48281 Fam49a-205ENSMUST00000223061 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
VdrP48281 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
VdrP48281 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
VdrP48281 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
VdrP48281 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
VdrP48281 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
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