Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Amd-ps1-201ENSMUST00000120127 994 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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Hoxd9P28357 Rapgef6-210ENSMUST00000207429 5164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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Hoxd9P28357 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm43766-201ENSMUST00000200590 5417 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Ankfn1-203ENSMUST00000169201 2232 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms