Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms