Protein–RNA interactions for Protein: D3YXG0

Hmcn1, Hemicentin-1, mousemouse

Predictions only

Length 5,634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn1D3YXG0 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Adgrg1-202ENSMUST00000179619 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Tbc1d14-203ENSMUST00000126077 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Zswim9-202ENSMUST00000119139 3986 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm10556-201ENSMUST00000180904 3906 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Pla2g2c-202ENSMUST00000105808 3448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm5386-201ENSMUST00000121749 2450 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 AC167013.3-201ENSMUST00000228110 989 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Man2b1-201ENSMUST00000034121 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Cd101-202ENSMUST00000167086 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Epn2-202ENSMUST00000108711 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Mical2-201ENSMUST00000037991 3352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Usp28-201ENSMUST00000047349 4133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Ttc41-205ENSMUST00000219108 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hmcn1D3YXG0 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms