Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms