Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm32842-201ENSMUST00000212653 738 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
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Hdac5Q9Z2V6 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 EPPK1-201ENSMUST00000226781 12325 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Dmxl2-201ENSMUST00000118163 10614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Myof-201ENSMUST00000041475 6902 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Cdc14b-202ENSMUST00000109769 2886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm26888-201ENSMUST00000181119 3683 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Mei1-203ENSMUST00000188048 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Rag1-201ENSMUST00000078494 6608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Rngtt-202ENSMUST00000108153 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 F10-202ENSMUST00000063820 2503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Hdac5Q9Z2V6 Olfr1219-205ENSMUST00000217421 5849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Hdac5Q9Z2V6 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Hdac5Q9Z2V6 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Hdac5Q9Z2V6 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Hdac5Q9Z2V6 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm6284-201ENSMUST00000209609 4287 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Hdac5Q9Z2V6 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Hdac5Q9Z2V6 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Hdac5Q9Z2V6 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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