Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn17Q8BXA6 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms