Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms