Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm7546-202ENSMUST00000211354 275 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 AC122533.2-201ENSMUST00000223772 545 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Panx3-201ENSMUST00000011262 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Rfx2-202ENSMUST00000086801 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Parp9-201ENSMUST00000023622 2973 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Add2-209ENSMUST00000204059 8182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 AC132412.1-201ENSMUST00000204155 2724 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm43544-201ENSMUST00000196474 2472 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Grk1-202ENSMUST00000209909 7431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Grk1-201ENSMUST00000033827 7425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Utrn-204ENSMUST00000217994 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Zfp607b-201ENSMUST00000076421 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm1070-201ENSMUST00000114185 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl11-201ENSMUST00000025836 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gatad2b-205ENSMUST00000199754 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm37120-201ENSMUST00000193350 5959 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Eri2-207ENSMUST00000150844 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Polq-201ENSMUST00000054034 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 D630039A03Rik-201ENSMUST00000063816 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm37315-201ENSMUST00000194347 3479 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Dcdc2a-202ENSMUST00000069614 6634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Triml2-204ENSMUST00000210136 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Fgr-201ENSMUST00000030693 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Ccnt1-201ENSMUST00000012104 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm28775-201ENSMUST00000186918 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d14-221ENSMUST00000171385 3884 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Mrps5-201ENSMUST00000028852 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm11189-201ENSMUST00000117979 375 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 AC126805.1-201ENSMUST00000225142 262 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Rab27a-203ENSMUST00000184146 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Polr3f-201ENSMUST00000028914 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Samd3-201ENSMUST00000060716 1874 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Pcdh15-216ENSMUST00000131724 6322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Slfn5-202ENSMUST00000108157 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Sfi1-210ENSMUST00000140846 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Kirrel3-206ENSMUST00000187625 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Tprkb-201ENSMUST00000067137 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Thsd1-203ENSMUST00000162447 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Rnf6-208ENSMUST00000169407 3276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 D830032E09Rik-203ENSMUST00000189845 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm42979-201ENSMUST00000196287 2228 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Nrep-201ENSMUST00000051087 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Neu3-201ENSMUST00000036331 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 CU024890.1-201ENSMUST00000221361 2019 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrc43Q3V0L5 Bdnf-206ENSMUST00000111046 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms