Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atp2b3Q0VF55 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms