Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Ttll8-201ENSMUST00000109371 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Fbxl2-201ENSMUST00000035090 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Cfap58-201ENSMUST00000066308 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm14749-201ENSMUST00000121269 333 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm38289-201ENSMUST00000194273 597 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Spa17-201ENSMUST00000002013 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 AC167019.4-201ENSMUST00000226494 1070 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Spag11a-201ENSMUST00000058955 436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm24143-201ENSMUST00000082633 145 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Crebbp-205ENSMUST00000205765 7749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Wipf3-206ENSMUST00000172046 4204 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Mcf2-202ENSMUST00000063507 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm26628-201ENSMUST00000181028 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm43041-201ENSMUST00000200022 2630 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Abhd2-201ENSMUST00000037315 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Paqr8-204ENSMUST00000189400 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Cenpu-201ENSMUST00000034045 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Ndst3-206ENSMUST00000154668 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Tango2-201ENSMUST00000115628 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm28410-201ENSMUST00000188113 1450 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 2310001H17Rik-202ENSMUST00000181238 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gsdmc3-202ENSMUST00000185526 2179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm37699-201ENSMUST00000194753 3338 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Myo1h-201ENSMUST00000124316 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Unc13d-203ENSMUST00000106451 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Zswim9-202ENSMUST00000119139 3986 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Unc13d-201ENSMUST00000075036 3967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Emc1-202ENSMUST00000082262 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Zfp936-203ENSMUST00000202535 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Oprm1-217ENSMUST00000105615 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm13666-201ENSMUST00000120032 799 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 1700092C02Rik-201ENSMUST00000134397 359 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm8340-201ENSMUST00000165508 1191 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm7352-201ENSMUST00000167577 1192 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Commd3-212ENSMUST00000171845 938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm8266-201ENSMUST00000179745 1192 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Mark1-ps3-201ENSMUST00000184922 694 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Zfp82-207ENSMUST00000183190 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Cnksr3-202ENSMUST00000150282 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Wee2-201ENSMUST00000038907 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Ttc21b-201ENSMUST00000102718 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Slc15a5-206ENSMUST00000171804 2461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Mmp19-201ENSMUST00000026411 3402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Nod2-202ENSMUST00000109634 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Tbccd1-201ENSMUST00000004576 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Kalrn-212ENSMUST00000114973 5253 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Otx2-210ENSMUST00000227404 2086 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Epn2-202ENSMUST00000108711 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Ncam1-204ENSMUST00000193547 6050 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Casp8-202ENSMUST00000165549 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm27166-201ENSMUST00000184476 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Adcy9-202ENSMUST00000117801 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm25167-201ENSMUST00000104188 120 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm14835-201ENSMUST00000119039 315 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sox12Q04890 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms