Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Dlg2-201ENSMUST00000074273 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Olfr161-202ENSMUST00000216259 7133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Trim2-206ENSMUST00000107695 7200 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Dock9-201ENSMUST00000040700 7803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Dmxl2-201ENSMUST00000118163 10614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Bcat1-201ENSMUST00000032402 7833 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Vmn1r199-202ENSMUST00000227685 5713 ntAPPRIS P2 BASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms