Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 C78859-201ENSMUST00000212800 5943 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 4932431P20Rik-202ENSMUST00000141713 9288 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Slc43a2-211ENSMUST00000169547 7145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Zfp652-202ENSMUST00000107717 10433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
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PtprmP28828 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
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PtprmP28828 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Erc1-201ENSMUST00000032279 8356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
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PtprmP28828 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
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PtprmP28828 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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PtprmP28828 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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PtprmP28828 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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PtprmP28828 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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PtprmP28828 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
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PtprmP28828 Sept3-201ENSMUST00000023095 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PtprmP28828 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
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