Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Ociad1-203ENSMUST00000166823 3354 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Plch1-208ENSMUST00000160638 6271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm12578-201ENSMUST00000121244 417 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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Hoxd9P28357 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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Hoxd9P28357 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Kansl1-203ENSMUST00000106971 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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