Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms