Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms