Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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