Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Usp1Q8BJQ2 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Usp1Q8BJQ2 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Usp1Q8BJQ2 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Usp1Q8BJQ2 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Usp1Q8BJQ2 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Usp1Q8BJQ2 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Usp1Q8BJQ2 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Usp1Q8BJQ2 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Usp1Q8BJQ2 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Usp1Q8BJQ2 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Usp1Q8BJQ2 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Usp1Q8BJQ2 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Usp1Q8BJQ2 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Usp1Q8BJQ2 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp1Q8BJQ2 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms