Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Olfr1189-202ENSMUST00000213679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Ercc6-201ENSMUST00000066807 8423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Ctnnd1-216ENSMUST00000111690 5945 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Olfr750-202ENSMUST00000216202 5789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Olfr943-202ENSMUST00000213176 8275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Fam135b-201ENSMUST00000022953 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Fam60a-209ENSMUST00000203164 2442 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Olfr1414-201ENSMUST00000062353 6017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Vmn1r26-203ENSMUST00000228070 4419 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm37633-201ENSMUST00000192858 2700 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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