Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Trpm6-201ENSMUST00000040489 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms