Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Adar-202ENSMUST00000098924 5909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Rnasel-201ENSMUST00000086209 2938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Selenop-203ENSMUST00000159216 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm43684-201ENSMUST00000199279 6573 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Pla2r1-201ENSMUST00000112525 7112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Olfr212-202ENSMUST00000218028 2291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 AC159813.1-201ENSMUST00000222671 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm4451-201ENSMUST00000186000 1891 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Prpf4-201ENSMUST00000084524 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Rad51ap1-201ENSMUST00000112220 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gpbp1-201ENSMUST00000047627 3694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Chd7-202ENSMUST00000051558 10216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Pygb-201ENSMUST00000045441 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Sec24c-201ENSMUST00000048657 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Map4k4-213ENSMUST00000193682 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Grb10-203ENSMUST00000109654 4755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Rhof-204ENSMUST00000186469 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm15574-201ENSMUST00000119937 405 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Lrrc43Q3V0L5 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Lrrc43Q3V0L5 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Lrrc43Q3V0L5 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Lrrc43Q3V0L5 Anpep-202ENSMUST00000107392 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Dusp27-202ENSMUST00000192369 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Cd300lg-203ENSMUST00000107164 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Pikfyve-202ENSMUST00000097707 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm35608-201ENSMUST00000218472 2370 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Tmprss11g-202ENSMUST00000140095 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Nfam1-202ENSMUST00000100377 2881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Dync2h1-202ENSMUST00000139115 2892 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Lrrc43Q3V0L5 Rmi1-205ENSMUST00000225828 3594 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Vsig1-201ENSMUST00000033806 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Bag6-211ENSMUST00000173550 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Nucb1-210ENSMUST00000211765 4853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Ighg3-202ENSMUST00000223179 2414 ntAPPRIS P5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Lrrc43Q3V0L5 F730016J06Rik-202ENSMUST00000128888 3699 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Rps6ka1-205ENSMUST00000157067 2637 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Flnb-201ENSMUST00000052678 9100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Emc1-205ENSMUST00000179784 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Txk-202ENSMUST00000169534 2344 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gria1-204ENSMUST00000151045 5361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm6592-201ENSMUST00000115563 507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms