Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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Gm28047Q3US59 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
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Gm28047Q3US59 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
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Gm28047Q3US59 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
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Gm28047Q3US59 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
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Gm28047Q3US59 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
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Gm28047Q3US59 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms