Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Cnga2-201ENSMUST00000006020 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Prdm16-204ENSMUST00000105636 8426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Stag1-201ENSMUST00000041418 5909 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gmeb2-201ENSMUST00000049032 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Pus7-206ENSMUST00000148618 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Atg12-201ENSMUST00000035648 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Grik1-206ENSMUST00000211444 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38024-201ENSMUST00000192338 2532 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gigyf2-205ENSMUST00000172794 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26628-201ENSMUST00000181028 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem19-209ENSMUST00000219890 2949 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Cd36-201ENSMUST00000082367 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 4933433G08Rik-201ENSMUST00000217392 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Slc11a2-205ENSMUST00000138843 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Rpgr-204ENSMUST00000115532 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn12-203ENSMUST00000115446 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Uhrf1-201ENSMUST00000001258 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10696-201ENSMUST00000161475 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 E330012B07Rik-202ENSMUST00000151979 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Atp6ap2-201ENSMUST00000033313 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr152-201ENSMUST00000096338 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Pcyt1a-201ENSMUST00000079791 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32335-201ENSMUST00000216896 2948 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf7l2-211ENSMUST00000111658 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Tyms-201ENSMUST00000026846 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28427-201ENSMUST00000190144 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38072-201ENSMUST00000192127 2162 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Tgm5-201ENSMUST00000028721 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Vps39-201ENSMUST00000028752 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Egflam-202ENSMUST00000096494 4391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Sh3rf1-202ENSMUST00000209611 4416 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Cnr2-201ENSMUST00000068830 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 AC142266.1-202ENSMUST00000227784 3733 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Pla2r1-201ENSMUST00000112525 7112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Lypd5-201ENSMUST00000032683 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Mkrn2-201ENSMUST00000000449 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42788-201ENSMUST00000201604 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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