Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Cntn3Q07409 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Cntn3Q07409 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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Cntn3Q07409 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Cntn3Q07409 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms