Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms