Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Rhoh-201ENSMUST00000031106 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DmdP11531 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Zc3h12c-201ENSMUST00000165519 6133 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DmdP11531 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
DmdP11531 Cmtr1-201ENSMUST00000024816 6380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
DmdP11531 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
DmdP11531 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
DmdP11531 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
DmdP11531 Olfr760-ps1-201ENSMUST00000172563 748 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
DmdP11531 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
DmdP11531 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms