Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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