Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms