Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm20257-201ENSMUST00000185352 936 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 4930568A12Rik-201ENSMUST00000186117 498 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Gm21060J3KMU4 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm21060J3KMU4 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm21060J3KMU4 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm21060J3KMU4 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm21060J3KMU4 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Gm21060J3KMU4 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms