Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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