Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Lhfpl2-204ENSMUST00000121618 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Slc43a2-211ENSMUST00000169547 7145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Phlpp2-203ENSMUST00000179721 7846 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Sdk2-201ENSMUST00000041627 11287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Deptor-202ENSMUST00000096433 8547 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Acsl6-204ENSMUST00000093106 5804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Unc79-208ENSMUST00000179002 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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