Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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