Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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