Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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Usp27Q8CEG8 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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Usp27Q8CEG8 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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Usp27Q8CEG8 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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Usp27Q8CEG8 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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Usp27Q8CEG8 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp27Q8CEG8 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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